实验教学中心（以下简称“中心”）创建于1990年农畜产品加工系，开设了农产品贮藏加工专业，实验教学以基础课程为准，设置了贮藏保鲜实验室、食品化学实验室和农畜产加工实验室，设备简陋，实验内容以验证性实验为主。

1993年食品科学系组建了粮油加工实验室、果蔬加工实验室、畜产品加工实验室、微生物实验室、果蔬贮运实验室、化学实验室等6个实验室。2002年以“优化资源配置、提高使用效率”为宗旨，将原有的6个实验室整合成农畜产品加工实验室、食品化学实验室、食品微生物实验室、果蔬采后生理与贮运实验室等4个实验室。2007年成立了院级农产品加工实验教学中心，配备1名专职实验室主任。2008年获批校级重点实验室—果蔬采后生理及保鲜实验室。2010年将原药学学院实验室并入，成立了食品科学与药学学院本科实验教学中心。

 “中心”依托“食品科学与工程”一级学科，服务于本科和研究生人才培养、科学研究和社会服务。培养学生实践能力、创新能力和解决复杂工程问题的能力；促进产学研融合，服务区域食品产业升级；推动实验教学改革与课程体系优化。

 “中心”现有教师人数59名，其中6名专职人员，高级职称占比45.7%，博士占比61%。“中心”有9个功能实验室和61间分实验室，1条葡萄酒生产线，8间冷库，1个本科仿真模拟实验室，校企共建“馕”研究工作室、“中亚植物蛋白与营养健康创新中心”，形成基础-综合-创新实验的分层实验教学体系。面向食品科学与工程、食品质量与安全、葡萄与葡萄酒工程等4个专业开设41门实验课，实验学生人数/年929，实验人时数/年750632。

 “中心”总面积达5276平方米，配备气相色谱-质谱联用仪、液相色谱仪、气相色谱仪、电感耦合等离子体质谱仪（ICP-MS）、CO₂超临界萃取设备、食品物性仪、流变仪、葡萄酒快速分析仪等高端设备，实验仪器及其配套设备2370台/件，总价值3370余万元。

 “中心”面向学生创新团队、校外科研院所和小型企业开放设备与场地，支持创新创业项目。近五年，“中心”主办新疆葡萄酒全产业链人才培训项目；中心教师主持教研教改项目50余项，发表教研论文30余篇；承担各级各类科研项目330余项，其中国家级项目22项，省部级以上项目46项，累计到位科研经费8400余万元；获批专利授权38项，其中专利转化7项；获各级各类科学技术进步奖10余项，自治区专利奖二等奖1项。学生在“挑战杯”与“互联网＋”创新创业等大赛中获奖100余项，其中国家级奖27项。现已基本形成教学、科研和科技开发服务为一体的综合实践平台。