新疆农业大学食品科学与药学学院食品科学与工程学科2010年获新疆重点学科建设，2011年获批新疆唯一“食品科学与工程”一级学科硕士学位授权点，2014年获自设“园艺产品采后科学与技术”二级学科博士学位点，2019年“食品科学与工程”获校级优势特色学科（学位点）建设。
学科下设食品科学、农产品加工及贮藏工程、食品营养和食品安全4个学科方向。学院同时设有食品加工与安全农业硕士学位授权点，科研平台主要有新疆果品采后科学与技术自治区重点实验室、食品科学与工程实验教学示范中心、食品质量与安全重点实验室、新疆特色果品加工保鲜工程技术中心、新疆葡萄与葡萄酒教学实训基地等省部级教学科研平台及校级新疆药用植物功能研究实验室和农产品贮藏与加工重点实验室，以及果蔬采后生理与贮运研究室、葡萄果实风味代谢及调控实验室、果蔬加工原理与技术研究室、药食两用植物功能性成分研究室、珍稀濒危药用植物研究室、果蔬精深加工技术研究室、食品生物发酵与质量安全研究室等研究室。
同时，本学科在疆内食品企业如新疆顶泰食品科技有限公司、新疆于田瑰觅生物科技股份有限公司、新疆中检众联检验认证技术有限公司、新疆特丰药业股份有限公司等建有校外实习基地达19个。
食品科学与工程学科近5年，获批各级科研项目230余项，科研经费3470万元，其中国家级项目36项；省部级科研项目60项，科研经费1227.6万元。
先后获得专利授权33项，其中发明专利26项；获得科研、教学成果奖励10项，近5年在核心期刊发表论文528篇（SCI收录34篇）。共主编、参编著作、教材5部，其中主编2部，参编3部。
本学科为新疆食品产业发展培养和输送了大批专业人才，尤其是少数民族专业人才，在新疆经济发展和特色资源加工转化中发挥了重要作用，为乡村振兴和脱贫攻坚提供科技支撑，形成了自己的科研和人才培养特色。
