新疆农业大学食品科学与药学学院设有1个本科实验教学中心，1个中试研发中心，9个研究室，面积7000余平方米，拥有自治区新疆果品加工与保鲜工程技术研究中心、自治区产学研联合培养研究生示范基地和葡萄酒生产车间，在大中型食品药品企业和研究院所建立校外实习基地19个。
近五年主持国家级、省部级、厅局级项目230余项，横向项目32项，科研经费3470万元，其中国家级项目36项；各类省部级科研项目60项。其中包括主持国家科技部重点研发项目“特色经济林采后果实与副产物增值加工关键技术”子课题，国家科技支撑计划子课题“民族特色工业化谷物制品加工关键技术与装备开发”，国家科技支撑计划“新丝路经济带民族特色农产品品牌培育科技示范工程”、“西域特色熏制菜肴加工关键技术研究及产业化应用”、自治区重大专项“马（运动、肉用、乳用）生产关键技术研究与示范”、“新疆特色酒庄葡萄酒质量安全控制技术研究”、“民族特色果蔬加工关键技术研究”、“新疆特色果树高效安全生产关键技术研究集成与示范”等重大项目。获得国家自然科学基金25项，获得专利授权33项，其中发明专利26项；近五年在核心期刊发表论文529篇（SCI收录34篇），获得科研、教学成果奖励10项，其中“诱导抗性技术的开发及其在厚皮甜瓜综合防腐保鲜中的推广应用”获得甘肃省科学技术进步一等奖，“新疆特种乳食品安全地方标准的研制与应用”获得自治区科学技术进步二等奖，“新疆杏子主栽品种品质数据库建立和贮运加工技术开发与示范”获得自治区科学技术进步二等奖，“杏仁综合利用关键技术开发与示范”、“葡萄原花青素提取与纯化技术的研究与应用”、“番茄红素粉生产技术的研究及应用”获得自治区科技进步三等奖，“从热榨植物油脂饼粕中制备蛋白粉关键技术研究”获乌鲁木齐市科技进步奖三等奖。
